550万个灰枣接穗的品种纯度进行鉴定
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新疆农林业司法鉴定所司法鉴定检验报告书
新农林检字[2008]第0321号
一、基本情况
委托单位:新和县塔木托格拉克乡人民政府
委托鉴定事项:对新和县塔木托格拉克乡所采购的550万个灰枣接穗的品种纯度进行鉴定。
受理日期:2008年3月21日
鉴定材料:枣树接穗
鉴定日期:2008年3月21日
鉴定地点:新和县新疆惠华食品有限公司6号冷库
在场人员:朱永刚、刘国权、阿地力阿吾提、海仁沙,张长江、任生理。
二、检案摘要
新和县塔木托格拉克乡人民政府采购了550万个灰枣接穗,为查清该批灰枣接穗的纯度,特委托我所对550万个灰枣接穗的品种纯度进行鉴定。
三、检验过程
我所接受委托后,于2008年3月21日指派鉴定人员张长江、任生理二人组成鉴定组,到达新和县新疆惠华食品有限公司6号冷库,提取了枣树接穗样品:
(一)、所取样品的抽样基数为550万个灰枣接穗(分装在522个塑料袋内)。
(二)、检验方法及过程:
1、DNA模板的制备
提取程序参照Paterson所述的CTAB法。
(1)取3g接穗枝皮,在液氮冷冻下迅速研磨成粉末,放入50mL离心管中,加入15mL裂解缓冲液(65℃),混匀,65℃水浴30~60mim
(2)水浴后加入等体积的氯仿-异戊醇(24:1),16℃,5000r/min,离心10min。
(3)吸取上清液加入等体积氯仿-异戊醇(24:1),4℃,5000r/min,离心10min。
(4)吸取上清液加入0.6倍体积的冰冻异戊醇,沉淀DNA。
(5)DNA用70%乙醇侵洗2~3次。室温干燥后,容于700μL 1×TE中。
(6)加入15μLRNaseA,37℃水浴保温1h。
(7)加入等体积的酚-氯仿溶液,10000r/min 4℃ 离心10min。
(8)吸取上清液加等体积的氯仿-异戊醇(24:1),10000r/min 4℃ 离心10min。
(9)吸取上清液加等体积的水饱和乙醚和1/3体积的5M NaCl,10000r/min 4℃ 离心10min。
(10)吸取上清液,加入1/10体积3M醋酸钠,2倍体积的无水乙醇。静止2~5min,挑DNA,风干,加100μL 1×TE溶解。-20℃下保存备用。
(12)用紫外分光光度计测定DNA样品的质量和浓度。根据测定数值,稀释DNA至试验需要浓度。
2 AFLP扩增与产物检测(以下过程均在德国Biometra公司生产的T Gradient PCR仪中进行)
2.1 AFLP扩增体系及扩增程序
(1)模板DNA的酶切体系及条件
成分 体积
DNA(150ng/μL) 3μL
H2O 14.3μL
10×NEB Buffer 2μL
100×BSA 0.2μL
Mse I(15U/μL) 0.2μL
EcoR I(10/μL) 0.3μL
总体积20μL/管
酶切温度37℃,时间3h。
(2)酶切DNA片断的连接体系及条件
DNA在酶切后加入以下成分,总体积30μL/管。37℃下过夜,连接结束后65℃变性10min。
成分 体积
H2O 2.7μL
10×T4 Buffer 3μL
EcoR I接头(5p mole/μL) 1.0μL
Mse I接头(50p mole/μL) 1.0μL
10mM ATP 1.8μL
T4-DNA连接酶(3U/μL) 0.5μL
(3)连接产物的预扩增体系和扩增程序
将连接产物用0.1×TE稀释10倍用于预扩增。
成分 体积
连接稀释DNA 5μL
H2O 10.1μL
10×PCR Buffer 2μL
2.5mM dNTP 1.6μL
Mse I引物(M00,50ng/μL) 0.6μL
EcoR I引物(M00,50ng/μL) 0.6μL
Taq酶(5U/μL) 0.1μL
矿物油 8μL
预扩增程序:
Step1 95℃ 2min
Step2 95℃ 30s
Step3 56℃ 30s
Step4 72℃ 60s
Step5 GO TO Step2 30 cycle
Step6 72℃ 10min
Step7 10℃ 10h
(4)DNA片断的选择扩增和扩增程序
将预扩增产物用0.1×TE稀释10倍用于预扩增。
成分 体积
预扩稀释DNA 5μL
H2O 9.85μL
10×PCR Buffer 2μL
2.5mM dNTP 1.8μL
Mse I引物(50ng/μL) 0.6μL
EcoR I引物(50ng/μL) 0.6μL
Taq酶(5U/μL) 0.15μL
矿物油 8μL
选择扩增程序:
Step1 95℃ 2min
Step2 95℃ 50s
Step3 65℃ 40s(每循环降低1℃)
Step4 72℃ 60s
Step5 GO TO Step2 13 cycle
Step6 95℃ 50s
Step7 56℃ 40s
Step8 72℃ 60s
Step9 GO TO Step6 31 cycle
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