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550万个灰枣接穗的品种纯度进行鉴定

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新疆农林业司法鉴定所司法鉴定检验报告书

新农林检字[2008]第0321号

一、基本情况

委托单位:新和县塔木托格拉克乡人民政府

委托鉴定事项:对新和县塔木托格拉克乡所采购的550万个灰枣接穗的品种纯度进行鉴定。

受理日期:2008年3月21日

鉴定材料:枣树接穗

鉴定日期:2008年3月21日

鉴定地点:新和县新疆惠华食品有限公司6号冷库

在场人员:朱永刚、刘国权、阿地力阿吾提、海仁沙,张长江、任生理。

二、检案摘要

新和县塔木托格拉克乡人民政府采购了550万个灰枣接穗,为查清该批灰枣接穗的纯度,特委托我所对550万个灰枣接穗的品种纯度进行鉴定。

三、检验过程

我所接受委托后,于2008年3月21日指派鉴定人员张长江、任生理二人组成鉴定组,到达新和县新疆惠华食品有限公司6号冷库,提取了枣树接穗样品:

(一)、所取样品的抽样基数为550万个灰枣接穗(分装在522个塑料袋内)。

(二)、检验方法及过程:

1、DNA模板的制备

提取程序参照Paterson所述的CTAB法。

(1)取3g接穗枝皮,在液氮冷冻下迅速研磨成粉末,放入50mL离心管中,加入15mL裂解缓冲液(65℃),混匀,65℃水浴30~60mim

(2)水浴后加入等体积的氯仿-异戊醇(24:1),16℃,5000r/min,离心10min。

(3)吸取上清液加入等体积氯仿-异戊醇(24:1),4℃,5000r/min,离心10min。

(4)吸取上清液加入0.6倍体积的冰冻异戊醇,沉淀DNA。

(5)DNA用70%乙醇侵洗2~3次。室温干燥后,容于700μL 1×TE中。

(6)加入15μLRNaseA,37℃水浴保温1h。

(7)加入等体积的酚-氯仿溶液,10000r/min 4℃ 离心10min。

(8)吸取上清液加等体积的氯仿-异戊醇(24:1),10000r/min 4℃ 离心10min。

(9)吸取上清液加等体积的水饱和乙醚和1/3体积的5M NaCl,10000r/min 4℃ 离心10min。

(10)吸取上清液,加入1/10体积3M醋酸钠,2倍体积的无水乙醇。静止2~5min,挑DNA,风干,加100μL 1×TE溶解。-20℃下保存备用。

(12)用紫外分光光度计测定DNA样品的质量和浓度。根据测定数值,稀释DNA至试验需要浓度。

2 AFLP扩增与产物检测(以下过程均在德国Biometra公司生产的T Gradient PCR仪中进行)

2.1 AFLP扩增体系及扩增程序

(1)模板DNA的酶切体系及条件

成分                                          体积

DNA(150ng/μL)                              3μL

H2O                                           14.3μL

10×NEB Buffer                                2μL

100×BSA                                      0.2μL

Mse I(15U/μL)                              0.2μL

EcoR I(10/μL)                              0.3μL

总体积20μL/管

酶切温度37℃,时间3h。

(2)酶切DNA片断的连接体系及条件

DNA在酶切后加入以下成分,总体积30μL/管。37℃下过夜,连接结束后65℃变性10min。

成分                                          体积

H2O                                            2.7μL

10×T4 Buffer                                  3μL

EcoR I接头(5p mole/μL)                     1.0μL

Mse I接头(50p mole/μL)                     1.0μL

10mM ATP                                       1.8μL

T4-DNA连接酶(3U/μL)                        0.5μL

(3)连接产物的预扩增体系和扩增程序

将连接产物用0.1×TE稀释10倍用于预扩增。

成分                                          体积

连接稀释DNA                                   5μL

H2O                                            10.1μL

10×PCR Buffer                                 2μL

2.5mM dNTP                                     1.6μL

Mse I引物(M00,50ng/μL)                    0.6μL

EcoR I引物(M00,50ng/μL)                   0.6μL

Taq酶(5U/μL)                               0.1μL

矿物油                                         8μL

预扩增程序:

Step1                     95℃                  2min

Step2                     95℃                  30s

Step3                     56℃                  30s

Step4                     72℃                  60s

Step5                  GO TO Step2              30 cycle

Step6                     72℃                  10min

Step7                     10℃                  10h

(4)DNA片断的选择扩增和扩增程序

将预扩增产物用0.1×TE稀释10倍用于预扩增。

成分                                          体积

预扩稀释DNA                                   5μL

H2O                                            9.85μL

10×PCR Buffer                                 2μL

2.5mM dNTP                                     1.8μL

Mse I引物(50ng/μL)                         0.6μL

EcoR I引物(50ng/μL)                        0.6μL

Taq酶(5U/μL)                               0.15μL

矿物油                                         8μL

选择扩增程序:

Step1                     95℃                  2min

Step2                     95℃                  50s

Step3                     65℃                  40s(每循环降低1℃)

Step4                     72℃                  60s

Step5                  GO TO Step2              13 cycle

Step6                     95℃                  50s

Step7                     56℃                  40s

Step8                     72℃                  60s

Step9                  GO TO Step6              31 cycle

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